Открыта при содействии муфтия Томской области. На выставке были представлены архивные документы, фотоматериалы, религиозные реликвии из мечетей Томска, экспонаты из личных коллекций членов татарской общины Томска. В перечне экспонатов выставки макет Белой мечети, священническое одеяние муфтия и наряд мусульманки, предметы религиозного культа и повседневного быта, религиозные издания и семейные реликвии.
Открыта при содействии Томской старообрядческой общины. На выставке были представлены архивные документы, фотоматериалы, религиозные реликвии из старообрядческого храма Томска, личные предметы репрессированного епископа. В перечне экспонатов выставки макет старообрядческого храма, богослужебное одеяние священника и женский наряд прихожанки, иконы и старинные старообрядческие рукописные книги из таежных скитов.
Привезена из Санкт-Петербурга и открыта в Мемориальном музее 28 октября 2008 г. Подготовлена творческим коллективом Научно- информационного центра «Мемориал» (Санкт –Петербург.) при участии: Forderverin fur Memorial St.Peterburg (Берлин), Центра немецкой культуры и примирения (Санкт-Петербург) при поддержке: Фондов Konrad Adenauer Stiftung, Ford Foundation, H.M. Jakson Foundation.
Открыта 6 августа 2008 г. - в день похорон в Москве А.И. Солженицына - выдающегося русского писателя, публициста, общественного и политического деятеля, Лауреата Нобелевской премии по литературе (1970). Был посетителем музея в период пребывания в Томске 24-26 июня 1994 года.
Открыта в 70- годовщину гибели в Томске великого русского поэта Н.А. Клюева. В перечне экспонатов выставки архивные документы из «ссыльного» и «расстрельного» дел поэта, фотоматериалы о жизненном и творческом пути Клюева, издания его книг, мемориальная доска с дома, где жил поэт накануне ареста, проект памятника Н.А. Клюеву в Томске.
Открыта в мае 2007 г. в рамках научно-музейной конференции «Шатиловские чтения-2007» и посвящена 125-летию со дня рождения и 70-летию гибели известного сибирского общественного деятеля, публициста, этнографа и музейного работника.
Главным экспонатом выставки стал проект нового Мемориального музея истории политических репрессий в Томске на Каштаке - месте массовых расстрелов в 1920-е -1950-е годы.
Выставка посвящена 120-летию со дня рождения С.Н. Дурылина (1886-1954 )- известного русского ученого-филолога, писателя, религиозного философа, историка театра, искусствоведа, чья судьба была связана с Томском как местом ссылки.
Основное содержание выставки- рассказ о трагической судьбе женщины, оказавшейся перед войной в сибирской ссылке в Нарымском крае, осмелившейся совершить побег с места поселения и в одиночку прошедшей по зимней тайге около 1,5 тысячи километров. Арестованной, осужденной на 10 лет лагерей, прошедшей все круги гулаговского ада и оставшейся не сломленной.
Открыта в марте 2003 г. и посвящена судьбе Р.С. Ильина (1891-1937), геолога, почвоведа, геоморфолога, автора более чем 100 научных работ и новых методов поиска полезных ископаемых. Расстрелян в Томске сентябре 1937 г.
