14 декабря 2022 года в Сибирской библиотеке города Томска прошло заседание, посвящённое 140-летию со дня рождения и 85-летию со дня гибели Михаила Шатилова, известного сибирского общественного и политического деятеля, этнографа и руководителя Томского краевого музея в 1922-1933 годы
После реконструкции 8 и 9 ноября 2022 г. состоялось открытие новой постоянной экспозиции Мемориального музея «Следственная тюрьма НКВД»
30 октября акции «Возвращение имен» и «Молитва памяти» прошли у Поклонного креста на месте массовых захоронений расстрелянных и в центре города в Сквере памяти у памятника жертвам большевистского террора на томской земле
В 2022 году Мемориальный музей принял участие в музейном проекте «Музейное дело. Сибирь», завершившееся выставкой в Музее истории ГУЛАГа (Москва)
29 января 2022 года в музее прошла последняя экскурсия перед масштабной модернизацией.
1 февраля музей закрылся для посеителей.