Музей располагает электронной базой данных почти на 200 тысяч человек, прошедших за годы правления советской власти на территории Томской области через горнило «чрезвычаек», «троек», раскулачиваний и массовых депортаций народов.
Родственники шведского дипломата Рауля Валленберга, пропавшего в советской тюрьме, направили официальные запросы в Федеральную службу безопасности РФ с просьбой предоставить документы, которые могут прояснить судьбу Валленберга.