Музей располагает электронной базой данных почти на 200 тысяч человек, прошедших за годы правления советской власти на территории Томской области через горнило «чрезвычаек», «троек», раскулачиваний и массовых депортаций народов.
С 8 по 14 декабря 2014 г. в Томском областном краеведческом музее им. М. Б. Шатилова прошли курсы повышения квалификации для специалистов музейной сферы.
